Automatizando busca de PDFs no Zotero e criação de planilha de artigos no Google Sheets

1. Importe sua biblioteca no Zotero

O primeiro passo é ter uma coleção de artigos no Zotero. Se você estiver utilizando o Rayyan para fazer o screening por título e resumo, siga o passo a passo abaixo. Se não, procure no Google como importar uma coleção para o Zotero no seu caso. 🤓

Exportando do Rayyan para o Zotero

Filtre na seção “Screening” somente os artigos incluídos. Nas reticências, clique em “Export” (Fig. 1), selecione “Filtered”, formato “BibTex” e clique em “Export” (Fig. 2).

Fig. 1

Fig. 2

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Na versão gratuita, note que somente o dono do projeto pode realizar essa ação.

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O arquivo virá em zip por e-mail com um .csv e o arquivo da coleção em si. Abra esse último arquivo com o Zotero, seja usando o “Abrir com…” do seu sistema operacional ou clicando em “File” → “Import…” por dentro do Zotero (Fig. 3).

Fig. 3

2. Encontre os PDFs

Ampliando a busca de full texts do Zotero

Na barra de ferramentas superior do Zotero, vá em “Edit” → “Settings” → “Advanced” → “Config Editor” (Fig. 4).

Fig. 4

Aceite o aviso e pesquise por “findpdf” até encontrar “extensions.zotero.findPDFs.resolvers”. Clique no ícone de edição e copie e cole o seguinte script:

[   {     "name": "PubMed Central Direct",     "method": "GET",     "url": "<https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC{pmcid}/pdf/>",     "mode": "direct",     "automatic": true,     "requires": "pmcid"   },   {     "name": "PubMed Search",     "method": "GET",     "url": "<https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term={title}>",     "mode": "html",     "selector": "a[data-ga-action='Free full text']",     "attribute": "href",     "automatic": true   },   {     "name": "SciELO Brazil",     "method": "GET",     "url": "<https://www.scielo.br/search/?q={title}&lang=en>",     "mode": "html",     "selector": "a[href*='/pdf/']",     "attribute": "href",     "automatic": true   },   {     "name": "SciELO Global",     "method": "GET",     "url": "<https://search.scielo.org/?q={title}>",     "mode": "html",     "selector": ".item-links a[href*='.pdf']",     "attribute": "href",     "automatic": true   },   {     "name": "Europe PMC",     "method": "GET",     "url": "<https://europepmc.org/search?query={title}>",     "mode": "html",     "selector": "a[href*='pdf']",     "attribute": "href",     "automatic": true   },   {     "name": "DOAJ Open Access",     "method": "GET",     "url": "<https://doaj.org/api/v3/search/articles/{doi}>",     "mode": "json",     "selector": "results[0].bibjson.link[[email protected]=='fulltext'].url",     "automatic": true   },   {     "name": "Crossref Unified",     "method": "GET",     "url": "<https://api.crossref.org/works/{doi}>",     "mode": "json",     "selector": "message.link[[email protected]=='application/pdf'].URL",     "automatic": true   },   {     "name": "Unpaywall OA",     "method": "GET",     "url": "<https://api.unpaywall.org/v2/{doi}[email protected]>",     "mode": "json",     "selector": "best_oa_location.url_for_pdf",     "automatic": true   },   {     "name": "Semantic Scholar",     "method": "GET",     "url": "<https://api.semanticscholar.org/graph/v1/paper/DOI:{doi}?fields=openAccessPdf,externalIds>",     "mode": "json",     "selector": "openAccessPdf.url",     "automatic": true   },   {     "name": "OpenAlex",     "method": "GET",     "url": "<https://api.openalex.org/works/doi:{doi}>",     "mode": "json",     "selector": "open_access.oa_url",     "automatic": true   },   {     "name": "CORE Discovery",     "method": "GET",     "url": "<https://core.ac.uk/api-v2/search?q=title:({title})&apiKey=DEMO-KEY>",     "mode": "json",     "selector": "data[0].downloadUrl",     "automatic": true   },   {     "name": "ResearchGate",     "method": "GET",     "url": "<https://www.researchgate.net/search?q={title}>",     "mode": "html",     "selector": "[data-testid='publication-item'] a[href*='.pdf']",     "attribute": "href",     "automatic": false   },   {     "name": "Academia.edu",     "method": "GET",     "url": "<https://www.academia.edu/search?q={title}>",     "mode": "html",     "selector": ".work-card a[href*='.pdf']",     "attribute": "href",     "automatic": false   },   {     "name": "LILACS (Latin America)",     "method": "GET",     "url": "<https://lilacs.bvsalud.org/portal/?q={title}>",     "mode": "html",     "selector": "a[href*='.pdf']",     "attribute": "href",     "automatic": true   },   {     "name": "Directory of Open Access Repositories",     "method": "GET",     "url": "<https://v2.sherpa.ac.uk/cgi/search/repository/simple?q={title}>",     "mode": "html",     "selector": "a[href*='.pdf']",     "attribute": "href",     "automatic": true   },   {     "name": "Internet Archive Scholar",     "method": "GET",     "url": "<https://scholar.archive.org/search?q={title}>",     "mode": "html",     "selector": "a[href*='.pdf']",     "attribute": "href",     "automatic": true   },   {     "name": "arXiv",     "method": "GET",     "url": "<https://arxiv.org/pdf/{arxiv_id}.pdf>",     "mode": "direct",     "automatic": true,     "requires": "arxiv_id"   },   {     "name": "bioRxiv",     "method": "GET",     "url": "<https://www.biorxiv.org/content/{doi}v1.full.pdf>",     "mode": "direct",     "automatic": true   },   {     "name": "medRxiv",     "method": "GET",     "url": "<https://www.medrxiv.org/content/{doi}v1.full.pdf>",     "mode": "direct",     "automatic": true   },   {     "name": "Sci‑Hub",     "method": "GET",     "url": "<https://sci-hub.ee/{doi}>",     "mode": "html",     "selector": "#pdf",     "attribute": "src",     "automatic": true   },   {     "name": "LibGen (scimag)",     "method": "GET",     "url": "<https://libgen.is/scimag/index.php?s={doi}>",     "mode": "html",     "selector": "a[href*='download']",     "attribute": "href",     "automatic": true   },   {     "name": "Anna's Archive",     "method": "GET",     "url": "<https://annas-archive.org/scidb/{doi}>",     "mode": "html",     "selector": "a[href$='.pdf']",     "attribute": "href",     "automatic": true   } ]

Você deve acabar com algo como a Fig. 5.

Fig. 5

Agora feche as configurações e selecione todos os artigos da sua coleção. Clique com o botão direito, selecione “Find Full Text” (Fig. 6) e o Zotero vai realizar a busca por você. 😍

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Dica: selecione o primeiro item da lista e use Shift + Click no último para selecionar tudo.

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Fig. 6